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web del Instituto de Biología Molecular y Celular
Dr. Gregorio Joaquín Fernandez Ballester

Unit: Molecular and Cellular Design
Subunit: Molecular Recognizement and Protein Engineering
Group: Protein Design and Molecular Modeling
Category: Investigator
Phone: + 34 966 65 84 41
Email: gregorio@umh.es
LinkedIn: gregorio-fernandez-ballester
Personal web site: http://adan-embl.ibmc.umh.es/gregorio/
Degree: Chemistry
Ph.D program:
Molecular Neurosciences, Institute of Neurosciences, Universidad de Alicante, 1992 (Director: Prof. José M. González Ros)
Postdoctoral positions:
1 – Centro de Edafología y Bilogía Aplicada del Segura (CEBAS) CSIC. Murcia. Spain (Prof. Antonio Cerdá). 1995-1997
2 – European Molecular Biology Laboratory (EMBL). Protein Structure Programm. Heidelberg. Germany. 2001-2002
Previous positions:
1 – Fellowship from Generalitat Valenciana. Universidad Alicante. 1988-1992.
2 – Postdoctoral Fellowship linked to Resarch Project from Spanish Ministry of Education. Universidad Alicante. 1992-1993.
3 – Postdoctoral Fellowship from Generalitat Valenciana. Universidad Complutense Madrid. 1993-1994.
4 – Postdoctoral Fellowship from Instituto de Fomento de la Region de Murcia. CEBAS. CSIC. 1995-1997.
5 – Assistant Professor of Biochemistry and Molecular Biology Step I. University Miguel Hernández (UMH), Spain. 1997-1999.
6 – Assistant Professor of Biochemistry and Molecular Biology Step II. University Miguel Hernández (UMH), Spain. 1999-2002.
7 – Assistant Professor Reasearch Contract at Dpt. of Biochemistry and Molecular Biology. University Miguel Hernández (UMH), Spain. 2002-2009.
8.- Associate Professor (Tenure), UMH, Spain. 2009.
Current Position: Professor of Biochemistry and Molecular Biology.
Research Fields:
Molecular modeling. Computational protein design. Molecular docking. Protein-protein interactions. Drug discovery.
Representative Publications:

  • Structure-based prediction of the S. cerevisiae SH3-ligand interactions. G. Fernandez-Ballester, P. Beltrao, J.M. Gonzalez, Y.H. Song, M. Wilmanns, A. Valencia and L. Serrano. J Mol Biol. (2009) 388:902-916
  • ADAN: a database for prediction of protein-protein interaction of modular domains. J.A. Encinar, G. Fernandez-Ballester, I.E. Sanchez, E. Hurtado-Gómez, F. Stricher, P.Beltrao and L. Serrano. Bioinformatics (2009) 25:2418-2424.
  • Differential role of the menthol-binding residue Y745 in the antagonism of thermally gated TRPM8 channels. Malkia A, Pertusa M, Fernández-Ballester G, Ferrer-Montiel A, Viana F.J. Mol Pain (2009) 5:62-74.
  • In silico-based direct evolution of peptides and peptidomimetics in drug discovery. G. Fernández-Ballester; A. Fernández-Carvajal; I. Devesa; B. Valenzuela; M.J. Duart; J.M. González-Ros and A. Ferrer-Montiel. Current Topics in Pharmacology (2011) 15:35-55.
  • The region adjacent to the C-end of the inner gate in Transient Receptor Potential Melastatin 8 (TRPM8) channels plays a central role in allosteric channel activation. F.J. Taberner; A. Lopez-Cordoba; G. Fernandez-Ballester; Y. Korchev; A. Ferrer-Montiel A. J Biol Chem. (2014). 289:28579-28594.

Patents and Available Technologies:
  1. Neuronal exocytosis inhibiting peptide and cosmetic composition and pharmaceutical composition containing the peptide. (Péptidos inhibidores de la exocitosis neuronal, composiciones cosméticas y farmacéuticas que los contienen). Ferrer-Montiel, A.V., Planells-Cases, R., Blanes-Mira, C., Llobregat, M., Fernández-Ballester, G., Gil, A., Gutiérrez, L.M., Viniegra, S., Carbonell, T. y Pérez-Payá, E. Nº de registro: WO0064932 (A1) ― 2000-11-02. Número España: ES19990000844 19990423 // 9900844/0 (Extendida vía PCT/ES00/00058). Entidad titular: Universidad Miguel Hernández. Paises: Internacional
  2. Improved citokyne design. Tur, V., van der Sloot, A.M., Mullally, M.M., Cool, R.H., Szegezdi, E.E., Samali, A., Fernández-Ballester, G., Serrano, L. and Quax, W.J. Nº de registro: WO0064932 (A1) ― 2005-06-23 // PCT/IB2004/004335. Entidad titular: University of Groningen; EMBL; National University of Ireland. Países: Internacional
  3. Compounds which inhibit muscle contraction. Cristina Carreno Serraima; Antonio Ferrer Montiel; Nuria Garcia Sanz; Wim Van Den Nest; Nuria Alminana Domenech; Juan Cebrian Puche; Gregorio Fernandez Ballester. Nº de registro: WO2011009626 (A1) ― 2011-01-27. Entidad titular: Lipotec, S.A.
  4. TRP-receptor-modulating peptides and uses thereof (Péptidos moduladores de receptores TRP y sus usos). Antonio Ferrer Montiel, Asia Fernández-Carvajal, Gregorio Fernandez Ballester, José Manuel González Ros, Carlos Belmonte Martínez, Félix Viana, Ana Gomis, Pierluigi Valente; María Camprubí-Robles; Wim Van Den Nest; Cristina Carreno Serraima. Nº de registro: WO2012/098281 A2 ― 2012-07-26 // WO2012098281 (A3) ― 2012-11-29. Entidad titular: UMH (50%), DiverDrugs (40%), CSIC (10%)
  5. Compuestos moduladores de receptores TRP y sus usos. Antonio Ferrer Montiel, Asia Fernández-Carvajal, Gregorio Fernandez Ballester, José Manuel González Ros, Carlos Belmonte Martínez, Félix Viana, Ana Gomis, Rosa María Planells-Cases, Miquel Vidal, Jordi Bujons, Angel Messeguer. Nº de registro: WO2012/136873 A2. Entidad titular: UMH (33%), CSIC (33%), CIPF (33%)
  6. Compounds which inhibit neuronal exocytosis. Ferrer Montiel, Antonio; Fernandez Ballester, Gregorio; Garcia Anton, Jose Maria; Carreno Serraima, Cristina; Alminana Domenech, Nuria; Delgado Gonzalez, Raquel. Nº de registro: WO2013153196 (A1) ― 2013-10-17 // WO2013153192 (A1) ― 2013-10-17 // WO2013153191 (A1) ― 2013-10-17 // EP2649984 (A1) ― 2013-10-16. Entidad titular: Lipotec, S.A.
Company agreements:
  1. Contrato de asesoramiento y asistencia en el desarrollo de la base de datos pública ADAN. Empresa/administración financiadora: Fundación Privada Centro de Regulación Genómica. Ref: FUNDCRG1.09ª. Duración, desde 2007 hasta 2009
  2. Contrato para la realización de un trabajo de investigación referente a la "Validación Terapéutica de Sistemas de Vehiculización de Fármacos en Modelos in vitro e in vivo de Cancer y Dolor". Entidad financiadora: LIPOTEC5.09D. Ref: ICDQ45. Duración, desde 2003 hasta 2010.
  3. Acuerdo de constitución de la plataforma de investigación en piel y anexos. Asociacion de investigacion de la industria textil (AITEX); asociacion para la investigacion de la industria del juguete / instituto tecnologico del juguete (AIJU); Bioarray SL; centro clinico de dermatologia sl; GP PHARM SA; instituto español del calzado y conexas. asociacion de investigacion (INESCOP); LIPOTEC SA. Ref: PIPA1.10X. Duración, desde 2010 hasta 2013.
  4. Contrato para la realización de un proyecto de investigación y desarrollo titulado "Identificación y Desarrollo de Productos Cosméticos" DIVERDRUGS. Ref: DIVERDRUGS1.13D. Duración, desde 2009 hasta 2014.